Hoi Gertjan,
Het is voor het tijdelijk omleggen van een route in feite hetzelfde als met het op slot zetten van de wegen.
Als het van korte duur is zal ik de route niet wijzigen.
Als ik de rest van het jaar tegen een foutmelding moet aankijken, lijkt mij dat een goede reden om de route aan te passen. 
De fout meldingen over onderbroken routes zijn zichtbaar op OSMinspector:
https://tools.geofabrik.de/osmi/?view=pubtrans_routes&lon=6.68112&lat=53.11977&zoom=11&baselayer=Geofabrik%20Standard&overlays=ptv2_routes_invalid%2Cptv2_error_ways%2Cptv2_error_nodes
Hoewel JOSM tegenwoordig goed om kan gaan met het opknippen van ways, ontstaan er met iD altijd volgorde fouten, die ik dan weer repareer. Ook als een weg wordt geblokkeerd (met access=no) of highway=construction, dan ontstaat er een foutmelding.

Het is dus eerder een uitzondering dat er een route tijdelijk wordt omgelegd.