Du hast in Deinem Kommentar geschrieben, "not existing node route deleted"
Tatsächlich hast Du aber nur ein Member (Mitglied) aus der Relation entfernt und damit eine route Relation stehen gelassen, in der nur noch der Knotenpunkt 95 drin war. Diese Route war somit ungültig und dass zeigt knooppuntnet eben an.
Ich werde meine Löschung rückgängig machen, dann kannst Du die richtigen Member wieder einfügen.