Ich habe mich beim Grundnetz in Potsdam ein bisschen mit komplizierten Kreuzungen beschäftigt, müsste mich aber auch nochmal einlesen, wo genau in solchen Fällen der Knotenpunkt bei Knotenpunktnetzen erfasst werden sollte. 
Wenn Du ein konkretes Beispiel mit Fragen hast, kann ich mit das gerne mal anschauen.