Ti ringrazio per le spiegazioni dettagliate. Data la situazione il tag più adatto è allora abandoned:amenity=drinking_water. Eliminarle del tutto non va bene perché seppure non hanno più la funzione originaria sono comunque ancora esistenti; aiuta inoltre a evitare che un nuovo mappatore vedendo l'elemento del tutto assente dalla mappa sia tentato di reinserirlo come fontanella funzionante.
Alcune di queste inoltre (penso a quelle di Rua Lunga e Via delle Terme) hanno anche una valenza storico-artistica che andrebbe segnalata (direi con historic=yes).
Se mi confermi che le cinque sono tutte ancora al loro posto le ripristino io mantenendo lo storico degli elementi OSM.