Anda, sí, tens raó. Aquest dos són els registres del NGMEP (en CSV):

17068000000;Foixà;17;Girona;Municipio;292;17068;0296-4;2,997994651;42,03884127;Investigación;79;Investigación;FALSO;FALSO
17068000001;Foixà;17;Girona;Capital de municipio;0;17068;0296-4;2,997994651;42,03884127;Mapa;79;Investigación;FALSO;VERDADERO

A l'eina https://osm-es.github.io/validador-ine/ faig un filtre per les dues últimes columnes del fitxer: han de ser FALSO totes dues, per a aparèixer al mapa.

Solen correspondre's amb "problemes": pot ser que hagin esborrat el codi (imagina't tres urbanitzacions [tres codis] plegades que, des d'un any concret, ara són només un nucli [un codi]). O potser, que no s'han creuat bé els dades entre administracions, perque una no s'actualitzat o qualsevol història. Per això, al validador ignoro aquests valors.