Этот ответ не позволяет понять, каким образом отмечать НИИ.
 Я написал, что исходил из названия. Если в нём выражается, что это по сути НИИ, то отмечать объект офисом на мой взгляд не верно, поскольку институт это более сложная структура, чем офис, даже если мы говорим о точечном объекте. 
Если бы в названии было указано что это "офис", или "лаборатория", или что то подобное, то да, это следовало бы отметить как office=research, но для "институтов" это обозначение явно уступает amenity=research_institute
Вы с этим согласны, или нет? Если нет, то предложите рабочую схему. Если да, то  давайте накатим.

По вашему примеру с проектным институтом. Да, это моя ошибка, не уследил. 

По поводу огульности, это необоснованное заявление. Правки делаются в соответствии с правилами описанными в вики, с ручной фильтрацией и проверкой изменений. Ошибки да, могут случаться, но они не говорят об огульности.

