お返事ありがとうございます。立体的な情報の欠落の点では、中庭のステージの部分がbuilding:part=roofだったこと（空洞になっていて屋根だけがある）が失われてしまっています。また、渡り廊下（真ん中の浮いているシアターと，左右の三角形の継ぎ目）の部分はbuilding:part=corridorとして表現していたはずで、個別のbuilding=yesとタグづけすると3Dレンダラにとっての形状以上のセマンティックな情報（両側の建物とつながっていて行き来できるなど）を失っているのではないでしょうか。