Obiekty na różnych layer nie powinny być łączone. Tutaj utworzyłeś przepust pod drogą dla strumienia https://www.openstreetmap.org/way/877962649 ale połączyłeś go z drogą 509 oraz chodnikiem biegnącymi nad tym przepustem.

Ten sam błąd zauważyłem w kilku miejscach w okolicy.

Niepoprawne jest też łączenie dróg z obszarami. W okolicy widzę, że masz je błędnie połączone.

Dodatkowo gęste dodawanie węzłów na w miarę prostej drodze nie jest poprawne. Warto ograniczać liczbę węzłów na drogach, bo podczas wyliczania tras w nawigacjach takie dodatkowe punkty  wydłużają czas obliczenia.

BTW - cieki wodne dobrze jest mapować z podkładem ISOK (Cieniowanie), bo wtedy lepiej widać ich przebieg a także gdzie zaczyna i kończy się przepust :)

Kilka korekt zrobiłem w tym CS: https://overpass-api.de/achavi/?changeset=146275767