Здесь я тоже случайно оказался - нет же никаких уведомлений в Веб-интерфейсе, чтобы заметить сообщения. Да, я теперь знаю, что объекты с отношениями не должны иметь общих точек и пересечений, я за этим слежу. И, кстати, до сих пор сам натыкаюсь на свои же объекты с  такими неправильными наложениями и исправляю их, пока просто удаляя отношения. И, что странно, эти ошибки не"обезвоживают" Вуоксу, видимо, для поломки нужна более-менее протяжённая линия или более одного неправильного отношения поблизости...